More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2462 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
421 aa  882    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 
392 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 
394 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 
454 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
438 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 
426 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
460 aa  130  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
466 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
528 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
309 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  31.17 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
312 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
924 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
477 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.4 
 
 
338 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
313 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
313 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.63 
 
 
754 aa  70.5  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
305 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
315 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
235 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
311 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  22.91 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.29 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.29 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.29 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.29 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.29 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
1435 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0441  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
331 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
308 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
307 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
672 aa  66.6  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
598 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.24 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.26 
 
 
295 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.71 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
822 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
322 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  24.26 
 
 
307 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
304 aa  64.3  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
338 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
337 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
841 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
334 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 
337 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  25.83 
 
 
292 aa  63.5  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
318 aa  63.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
321 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
753 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
306 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
307 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3168  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 
322 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.908462  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  26.09 
 
 
470 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1578  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
291 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0681892 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
310 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
581 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  26.48 
 
 
236 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  28.25 
 
 
317 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
623 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 
358 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
300 aa  61.6  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
428 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
294 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  22.13 
 
 
461 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.67 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
307 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6044  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
307 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 
331 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>