More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2970 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
322 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
314 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
324 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
323 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
335 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  29.05 
 
 
1065 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
312 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  33.83 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  23.95 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  28.98 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  25.98 
 
 
1041 aa  70.1  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0912  b-glycosyltransferase  25.9 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.780532  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
924 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
240 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  23.21 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  34.96 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1100  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
304 aa  63.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
248 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  36 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
485 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3118  family 2 glycosyl transferase  26.22 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
485 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
485 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
460 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 
479 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
337 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  37.72 
 
 
306 aa  59.7  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 
337 aa  59.7  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.83 
 
 
327 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  28.45 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.41 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  23.94 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  22.93 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.95 
 
 
505 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  25.95 
 
 
662 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  24 
 
 
235 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
312 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.93 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
301 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  23.12 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
256 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
256 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  28.44 
 
 
520 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  26.36 
 
 
633 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
325 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
247 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
324 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
333 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  32.03 
 
 
1074 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 
305 aa  56.2  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
306 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
299 aa  56.2  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
310 aa  56.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>