More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5890 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
301 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  43.26 
 
 
305 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  44.36 
 
 
291 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  41.84 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  40.37 
 
 
297 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.63 
 
 
309 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
477 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  41.47 
 
 
792 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
304 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
528 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
305 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
344 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
344 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 
321 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
785 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  32.56 
 
 
2401 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 
325 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  31.3 
 
 
322 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 
1340 aa  87  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
924 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  37.09 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  36.12 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
322 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.15 
 
 
1157 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.62 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  45.87 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2765  glycosyl transferase family protein  40.37 
 
 
626 aa  72.8  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
525 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  23.24 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.19 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.19 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  32.17 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.59 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.19 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.19 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.19 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
703 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
460 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.68 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  39.53 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  33.01 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
470 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.84 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
1162 aa  69.3  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
841 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  23.11 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  39 
 
 
222 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  24.87 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.44 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  31.49 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>