More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3182 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
322 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  87.89 
 
 
322 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
344 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
344 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
325 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 
753 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
477 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 
328 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  34.09 
 
 
792 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.7 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
321 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
528 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
305 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.55 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  30.54 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
924 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1570  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  35.53 
 
 
498 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.892629  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 
597 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
836 aa  73.2  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.49 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  30.06 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.49 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.49 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.49 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.49 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.49 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
841 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.48 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  30 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  28.02 
 
 
326 aa  68.9  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  27.14 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  28.57 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
323 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.04 
 
 
326 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  29.65 
 
 
292 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
455 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7660  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  31.02 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  29.09 
 
 
411 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0477  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
299 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.527373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
298 aa  63.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
884 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  28.02 
 
 
322 aa  62.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
1297 aa  62.8  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  23.71 
 
 
310 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1198  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 
318 aa  62.8  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
346 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>