More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0590 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0590  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
329 aa  682    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3554  glycosyl transferase family 2  88.15 
 
 
329 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  70.73 
 
 
329 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  62.01 
 
 
332 aa  444  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  39.08 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1887  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 
360 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95114  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 
331 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  36.31 
 
 
331 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  34.42 
 
 
348 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 
341 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  27.33 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.11 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
362 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
457 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
333 aa  62.8  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
597 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  22.69 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.28 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 
253 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
785 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
325 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.9 
 
 
325 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  26.2 
 
 
328 aa  59.3  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.27 
 
 
1099 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
1435 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  25.35 
 
 
310 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 
333 aa  57  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
326 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  22.89 
 
 
310 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
305 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  23.19 
 
 
345 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
322 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1040  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.852746  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
523 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  26.34 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
514 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6271  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
658 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.449119 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  26.09 
 
 
357 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  22.31 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  23.93 
 
 
822 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
274 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
329 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  23.43 
 
 
642 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
394 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  22.28 
 
 
339 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  24.15 
 
 
418 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
300 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
357 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
403 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  22.28 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
654 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
300 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  22.37 
 
 
298 aa  53.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
310 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  23.7 
 
 
321 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
310 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5180  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
322 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  24.76 
 
 
335 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
304 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
299 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
235 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.68 
 
 
123 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 
456 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
310 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  23.75 
 
 
307 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  25 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  22.4 
 
 
652 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  21.33 
 
 
312 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.93 
 
 
1115 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
410 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1965  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
286 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
272 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
257 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  33.33 
 
 
234 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  32.29 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
247 aa  50.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>