More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  100 
 
 
324 aa  637    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  60.13 
 
 
352 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  60.63 
 
 
341 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  60.57 
 
 
343 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  59.94 
 
 
343 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  60.51 
 
 
331 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  60.92 
 
 
352 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  48.74 
 
 
368 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  37.46 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  39.37 
 
 
340 aa  169  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 
339 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  35.85 
 
 
353 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
360 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 
389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
355 aa  139  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  31.96 
 
 
341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
333 aa  122  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
331 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
316 aa  112  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  29.31 
 
 
822 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
329 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  28.43 
 
 
351 aa  102  9e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  20.95 
 
 
341 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  22.7 
 
 
337 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
351 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.87 
 
 
1101 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  21.9 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  39.84 
 
 
484 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  21.79 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
1015 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
316 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  39.68 
 
 
264 aa  63.2  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 
277 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
477 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
398 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
260 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
311 aa  60.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  38 
 
 
387 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
350 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 
509 aa  60.1  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 
280 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 
350 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
373 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
345 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
399 aa  59.3  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  29.41 
 
 
316 aa  59.3  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
347 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
433 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  37.61 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
1032 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
240 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  24.79 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  24.02 
 
 
340 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  27.78 
 
 
325 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
686 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  19.57 
 
 
528 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 
752 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
1124 aa  56.6  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  27.75 
 
 
421 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  24.79 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  35.66 
 
 
338 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  27.75 
 
 
421 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
433 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 
380 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
924 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  29.15 
 
 
411 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
777 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  28.43 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  26.99 
 
 
236 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  25.91 
 
 
392 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
470 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  24.58 
 
 
442 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.11 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 
544 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
341 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
337 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  28.43 
 
 
433 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>