More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1850 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 362 aa  743    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  61.16 
 
 		 362 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  60.35 
 
 		 353 aa  421  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  56.39 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.76 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  36.12 
 
 		 334 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  42.42 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  42.42 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  38.5 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  40.91 
 
 		 328 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  39.3 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.94 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 340 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2373  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 		 329 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 315 aa  89.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 477 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 		 528 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.27 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.57 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  25.52 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 		 841 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  28.43 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  26.77 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 672 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 924 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 		 1101 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  24.59 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  28.35 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 753 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  30.33 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 752 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 623 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 		 501 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  26.48 
 
 		 838 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  27.95 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  25.96 
 
 		 633 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 722 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 		 748 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.48 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  23.58 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>