More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1407 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1407  putative glycosyl transferase  100 
 
 
243 aa  504  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  75.62 
 
 
248 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  55.83 
 
 
242 aa  263  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
316 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.48 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.48 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  29.95 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  29.95 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
544 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
1015 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  30.58 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
349 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 
672 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  31.88 
 
 
1014 aa  67  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
403 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40.38 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0910  glycosyl transferase  27.64 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.54 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  34.19 
 
 
338 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  27.75 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
1035 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
327 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.97 
 
 
253 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
333 aa  63.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
331 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
314 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
330 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 
1177 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3317  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  33.67 
 
 
314 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.45 
 
 
336 aa  62.4  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  36.63 
 
 
403 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
321 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
344 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0143  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
284 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 
1177 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 
253 aa  62  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.81 
 
 
345 aa  62  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.54 
 
 
253 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  26.05 
 
 
215 aa  62  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  27.54 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
340 aa  61.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
379 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0345  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0405304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
289 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.69 
 
 
326 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
380 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
397 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.58 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
379 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
333 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
379 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  33.91 
 
 
344 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
1301 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.04 
 
 
338 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
235 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  27.12 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
333 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
278 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
341 aa  60.1  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
321 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  27 
 
 
362 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
333 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
1038 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.12 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  26.96 
 
 
340 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  38 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
324 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  24.58 
 
 
425 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  24.58 
 
 
425 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  33.58 
 
 
410 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
349 aa  58.9  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  33.02 
 
 
311 aa  58.9  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
314 aa  58.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
327 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>