More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1131 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  100 
 
 
337 aa  696    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
528 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
924 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 
753 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
477 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
358 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
333 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.29 
 
 
309 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  32.93 
 
 
822 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
315 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
328 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
322 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
305 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  33.62 
 
 
236 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
304 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
311 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
351 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
331 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
322 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 
331 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
305 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
332 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  24.78 
 
 
352 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
322 aa  99.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  22.73 
 
 
341 aa  99.4  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
328 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  29.63 
 
 
792 aa  99.4  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
597 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  32.09 
 
 
461 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  23.65 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
355 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  41.44 
 
 
232 aa  96.3  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.08 
 
 
341 aa  96.3  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
311 aa  95.9  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  42.34 
 
 
235 aa  95.1  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
1035 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  24.01 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 
312 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
238 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
305 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
359 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  26.32 
 
 
334 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
240 aa  92.8  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
330 aa  92.8  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  25.79 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
348 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
316 aa  90.9  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 
335 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
322 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
235 aa  89.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
360 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
444 aa  89  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  22.7 
 
 
324 aa  89  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  24.41 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  40.71 
 
 
233 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 
325 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
333 aa  87  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
300 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  23.38 
 
 
353 aa  86.3  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
748 aa  85.9  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  27.86 
 
 
317 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  40.21 
 
 
232 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  25.91 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.19 
 
 
2401 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  28.74 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.56 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  24.46 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  26.23 
 
 
316 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 
479 aa  83.2  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
841 aa  83.2  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  23.27 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.17 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
1340 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
438 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0143  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  23.03 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  25.33 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>