98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2586 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  636    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  56.35 
 
 
321 aa  305  7e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  50.64 
 
 
334 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  52.02 
 
 
337 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  55.39 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  51.99 
 
 
300 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  52.35 
 
 
316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0697  glycosyl transferase family 2  33.45 
 
 
331 aa  165  9e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.561487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
597 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
477 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
924 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
528 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  24.83 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  26.72 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
421 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 
339 aa  62.8  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
360 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  29.24 
 
 
353 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  22.89 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
454 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 
328 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
296 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
310 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
301 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
331 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09478  putative glycosyltransferase  22.7 
 
 
309 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
260 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  21.13 
 
 
344 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  26.55 
 
 
341 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  25.53 
 
 
822 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
329 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  21.01 
 
 
333 aa  49.3  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  25.14 
 
 
352 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  25.31 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  30.2 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  22.98 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0043  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25 
 
 
282 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
460 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
311 aa  46.2  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
683 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 
394 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  24.38 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  23.91 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
753 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 
332 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  23.21 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
824 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  25.15 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  24.05 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.65 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  27.44 
 
 
792 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 
438 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  35.38 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  27.95 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
331 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
331 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
892 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
368 aa  43.5  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
274 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
355 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
236 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
335 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  24.85 
 
 
384 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  21.88 
 
 
461 aa  43.1  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  26.46 
 
 
754 aa  43.1  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  21.74 
 
 
306 aa  42.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0138  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
293 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39175  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
355 aa  42.7  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  22.77 
 
 
310 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
748 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
395 aa  42.4  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>