265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05860 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  100 
 
 
351 aa  721    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.8 
 
 
341 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  32.06 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
333 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
389 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
343 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
316 aa  123  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
360 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  29.33 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  28.07 
 
 
343 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
358 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  28.43 
 
 
324 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.65 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  27.64 
 
 
340 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
355 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  28.4 
 
 
822 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  27.03 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  25.86 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
509 aa  63.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
410 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  26.27 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  26.27 
 
 
421 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  26.27 
 
 
421 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
549 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
318 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  27.97 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  23.58 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  26.02 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  22.83 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 
315 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  22.75 
 
 
442 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  23.77 
 
 
399 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  23.77 
 
 
399 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0704  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
462 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439605  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  22.86 
 
 
924 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  22.98 
 
 
326 aa  56.6  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  24.89 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3376  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 
669 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
642 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
1523 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0380  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
311 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  21.4 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  22.32 
 
 
442 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 
331 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 
331 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  29.47 
 
 
316 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1745  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
353 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  25.29 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  26.98 
 
 
242 aa  52  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.8 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  22.06 
 
 
326 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
345 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  25 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
326 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  21.15 
 
 
418 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 
1162 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
331 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17181  glycosyl transferase family protein  22.83 
 
 
407 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
1523 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
360 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 
402 aa  50.4  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.5 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  23.01 
 
 
345 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  25 
 
 
425 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
622 aa  50.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 
420 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  25 
 
 
425 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  21.58 
 
 
477 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  22.36 
 
 
412 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  24.29 
 
 
451 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 
318 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.42 
 
 
441 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
441 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.42 
 
 
441 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.42 
 
 
441 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.42 
 
 
441 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  22.48 
 
 
322 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>