More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0354 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
331 aa  687    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  55.89 
 
 
332 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09478  putative glycosyltransferase  53.77 
 
 
309 aa  332  5e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  46.52 
 
 
322 aa  288  9e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  47.91 
 
 
344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  46.15 
 
 
335 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  44.03 
 
 
338 aa  256  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.22 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.17 
 
 
337 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
305 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
477 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
305 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
528 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
573 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
573 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  23.34 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  22.3 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  38.74 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  36.89 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  37.04 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
289 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  38.74 
 
 
697 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  35.4 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  23.53 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  44.44 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
924 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  39.77 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  24.6 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.45 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  39.36 
 
 
1168 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1379  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  28.04 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
334 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
1035 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  36.84 
 
 
1169 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0716  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000599057  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  36.63 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2393  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  28.72 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  38.04 
 
 
1157 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  23.46 
 
 
663 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.37 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  27.19 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
233 aa  67  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  21.9 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  22.41 
 
 
1120 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  22.54 
 
 
422 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  38.64 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.23 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  25.83 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  29.15 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
1038 aa  65.9  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
1177 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5523  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.17 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5280  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.17 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5124  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.17 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
311 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
260 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
1177 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
660 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  23.4 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  23.17 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  26.15 
 
 
316 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 
752 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  37.08 
 
 
102 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  23.39 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>