More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2333 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
327 aa  668    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
311 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
311 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
328 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
315 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  33.95 
 
 
321 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1198  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
318 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.43 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  27.88 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
1340 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
228 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 
528 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
691 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
235 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.69 
 
 
234 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
341 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.29 
 
 
253 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 
222 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  25.35 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  26.01 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
691 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
239 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
470 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.24 
 
 
253 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  30.1 
 
 
1837 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
226 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1407  putative glycosyl transferase  27.56 
 
 
243 aa  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
703 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
470 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.57 
 
 
253 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  26.42 
 
 
310 aa  63.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.26 
 
 
427 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
691 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
233 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.88 
 
 
253 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 
255 aa  62.8  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
358 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  25.6 
 
 
248 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
1739 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  29.38 
 
 
234 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0071  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
236 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
717 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  43.02 
 
 
240 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  41.76 
 
 
240 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
235 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
227 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
717 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0883  family 2 glycosyl transferase  29.15 
 
 
524 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
227 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  31.47 
 
 
242 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
430 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
710 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  34.09 
 
 
231 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
232 aa  60.5  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
247 aa  60.5  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
415 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  27.32 
 
 
228 aa  59.7  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.02 
 
 
2401 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
236 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  29.8 
 
 
272 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 
477 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.27 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.67 
 
 
193 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
245 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>