199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2563 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 329 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  98.48 
 
 		 329 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  79.64 
 
 		 329 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  57.69 
 
 		 331 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  55.95 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  52.38 
 
 		 341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  51.76 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  50.96 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  47.98 
 
 		 353 aa  252  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  43.63 
 
 		 355 aa  221  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  31.17 
 
 		 343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  30.1 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  29.13 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  34.02 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 		 358 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  30.82 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 368 aa  112  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 		 352 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 		 360 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.5 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  27.4 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  30.58 
 
 		 822 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  31.78 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  19.91 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  26.1 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.6 
 
 		 1099 aa  60.1  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 1101 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.1 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 358 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  25.82 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0808  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.5 
 
 		 279 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  23.85 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0704  polyprenyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.5 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  27.44 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 		 291 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 		 637 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 		 509 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  32.76 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 1120 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.99 
 
 		 789 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.99 
 
 		 789 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  27.99 
 
 		 789 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 224 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  27.14 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 		 1124 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 236 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  54.55 
 
 		 229 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 364 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 		 450 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 329 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 1359 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 		 841 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 		 1002 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5474  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.11 
 
 		 247 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224375 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 357 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.33 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  28.89 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 		 584 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 		 371 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3138  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 236 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>