More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2341 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3138  glycosyl transferase family protein  80.52 
 
 		 236 aa  370  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  50.88 
 
 		 244 aa  225  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  35.07 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.32 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  31.55 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40.82 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.35 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 752 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 622 aa  62.4  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 1015 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  31.98 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  26.64 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.17 
 
 		 1099 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  28.65 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 525 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  30.23 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 374 aa  58.9  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 		 637 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  28.87 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  29.35 
 
 		 403 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 333 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2187  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.54 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000104716  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  31.54 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 		 581 aa  56.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 738 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3289  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  26.15 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 		 380 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1549  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal  0.473314 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 287 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 689 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 373 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  26.88 
 
 		 306 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 1124 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  28.12 
 
 		 319 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>