More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1893 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  100 
 
 
234 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  95.3 
 
 
234 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  50.43 
 
 
236 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  46.26 
 
 
231 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  41.15 
 
 
228 aa  211  9e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  43.81 
 
 
227 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  40.09 
 
 
229 aa  192  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  46.9 
 
 
229 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  45.74 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  44.69 
 
 
227 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  33.19 
 
 
225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 
235 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  35.58 
 
 
422 aa  138  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 
232 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
458 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
441 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  32.91 
 
 
231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
227 aa  114  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
226 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
224 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
226 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
234 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  30.77 
 
 
229 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
244 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2276  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 
236 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
222 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  28.82 
 
 
228 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
226 aa  99.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
222 aa  98.6  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  29.75 
 
 
246 aa  94  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
232 aa  89  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
238 aa  88.6  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 
264 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
374 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
244 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  25.62 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
376 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.98 
 
 
361 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3258  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.777237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 
345 aa  75.5  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  27.35 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  30.2 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0711  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  39.56 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  32.49 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  33.69 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0589  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.91 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0282701 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  26.83 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12329  predicted protein  24.47 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
256 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
357 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  41.3 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.32 
 
 
242 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
327 aa  62  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 
299 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
301 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  38.2 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  39.36 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  39.36 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  40.82 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 
477 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
236 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
525 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
311 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
288 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
268 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
273 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 
672 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  33.04 
 
 
313 aa  55.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
322 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1126  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
390 aa  55.5  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.463481  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
328 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  23.37 
 
 
233 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.06 
 
 
123 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
274 aa  55.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>