292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2220 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  40.97 
 
 
229 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  41.55 
 
 
227 aa  165  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  42.17 
 
 
234 aa  164  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  39.82 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  35.44 
 
 
246 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  41.89 
 
 
224 aa  148  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
244 aa  148  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  38.22 
 
 
422 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 
238 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  38.22 
 
 
226 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 
222 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
458 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
226 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
441 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
228 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
226 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
251 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 
222 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2276  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
233 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 
225 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
435 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
227 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
230 aa  106  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
244 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  31.54 
 
 
242 aa  106  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
227 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
235 aa  104  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.43 
 
 
234 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.88 
 
 
236 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  28.82 
 
 
234 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  32.89 
 
 
230 aa  101  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
227 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  29.69 
 
 
227 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  30.97 
 
 
231 aa  99  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
229 aa  98.6  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.75 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.52 
 
 
227 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.82 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  29.56 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  31.47 
 
 
259 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0589  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.34 
 
 
375 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0282701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 
242 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  29.33 
 
 
228 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.03 
 
 
231 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  27.98 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  27.11 
 
 
229 aa  82  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
345 aa  75.5  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.75 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  27.23 
 
 
360 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  30.46 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  29.94 
 
 
322 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12329  predicted protein  25.91 
 
 
207 aa  58.9  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1040  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.852746  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
284 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0711  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 
348 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  34.86 
 
 
316 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
296 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
331 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
335 aa  52.4  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  22.18 
 
 
379 aa  52.4  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
785 aa  52.4  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 
366 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  25.24 
 
 
248 aa  52.4  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.82 
 
 
231 aa  52  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
328 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
321 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.23 
 
 
320 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
364 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  29.41 
 
 
325 aa  51.6  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  37.23 
 
 
320 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.74 
 
 
338 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
341 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
403 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
366 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
320 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
525 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
336 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
357 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>