More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0660 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
234 aa  464  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  56.03 
 
 
229 aa  232  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  55.31 
 
 
227 aa  227  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  53.33 
 
 
224 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  53.04 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  51.3 
 
 
244 aa  215  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  47.11 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  49.78 
 
 
222 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  51.08 
 
 
238 aa  205  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  42.17 
 
 
228 aa  164  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
232 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  38.5 
 
 
226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
227 aa  158  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  41.78 
 
 
227 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  40.71 
 
 
228 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
226 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  40.81 
 
 
441 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
233 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  40.62 
 
 
458 aa  136  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  38.49 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2276  glycosyl transferase family 2  41.13 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  37.77 
 
 
226 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  36.25 
 
 
242 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  40.26 
 
 
231 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 
435 aa  122  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  36.28 
 
 
228 aa  121  7e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  36.56 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  39.11 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.16 
 
 
236 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  37.12 
 
 
422 aa  116  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 
227 aa  116  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.2 
 
 
264 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
235 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.62 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  32.06 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  37.12 
 
 
231 aa  111  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  32.19 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  34.29 
 
 
228 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
232 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 
230 aa  105  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0589  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.99 
 
 
375 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0282701 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  30.08 
 
 
259 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
244 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  37 
 
 
229 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
229 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 
247 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.58 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
227 aa  98.2  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.86 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
376 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  29.74 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  35.8 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.6 
 
 
361 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
374 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  38.5 
 
 
345 aa  90.5  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  30.7 
 
 
360 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  30.8 
 
 
288 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12329  predicted protein  29.56 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0711  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
357 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1040  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.852746  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  33.33 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  42.7 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
335 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  42.05 
 
 
312 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
333 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  27.27 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.43 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  40.7 
 
 
389 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3258  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.777237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
360 aa  60.1  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 
328 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  29.74 
 
 
411 aa  58.9  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  40.62 
 
 
339 aa  58.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.29 
 
 
253 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
388 aa  58.5  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
345 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  38.64 
 
 
313 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0655  glycosyl transferase  41.3 
 
 
346 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0670645  normal  0.883616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  34.29 
 
 
310 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
335 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.96 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  26.29 
 
 
253 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  38.64 
 
 
310 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.35 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  35.79 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>