More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0723 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
348 aa  699    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0711  glycosyl transferase family 2  92.53 
 
 
348 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.37 
 
 
361 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  50.57 
 
 
374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  43.31 
 
 
376 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  39.14 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 
345 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
232 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
227 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
222 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  37.1 
 
 
229 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  31.96 
 
 
246 aa  99  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
232 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
234 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  38.97 
 
 
227 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
435 aa  93.6  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.86 
 
 
234 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  29.11 
 
 
230 aa  91.3  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  34.1 
 
 
227 aa  90.1  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  29.02 
 
 
422 aa  89.7  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  31.25 
 
 
234 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
227 aa  89.4  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  37.39 
 
 
231 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
227 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
222 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
230 aa  87  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
226 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
235 aa  85.9  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
238 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  25.81 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  32.74 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.73 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
458 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.02 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  28.9 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  27.27 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.3 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  29.8 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  28.33 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
428 aa  69.3  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.51 
 
 
229 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
264 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
226 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  31.12 
 
 
229 aa  62.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
357 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  25.12 
 
 
227 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
351 aa  61.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
229 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  26.83 
 
 
228 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  37.27 
 
 
1157 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
244 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
553 aa  59.7  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.04 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  26.48 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  25.36 
 
 
248 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.37 
 
 
227 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  40.66 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
269 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  37.27 
 
 
1148 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  33 
 
 
269 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
247 aa  56.2  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  28.7 
 
 
324 aa  55.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  31.18 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 
409 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  26.32 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
410 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  35.19 
 
 
242 aa  55.1  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.66 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
245 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
333 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  38.2 
 
 
1168 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
1032 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.17 
 
 
326 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 
1562 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.84 
 
 
380 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  32.32 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2900  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
397 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  22.17 
 
 
258 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
460 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
270 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  30.91 
 
 
247 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>