More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1437 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 324 aa  653    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.75 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.83 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.73 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.73 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  27.12 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  26.27 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  25.85 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  25.85 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  25.85 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  26.81 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.45 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.51 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  25.85 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  26.38 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  26.38 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  26.38 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  26.38 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  28.03 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  28.03 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.03 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.03 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0655  glycosyl transferase  34.08 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0670645  normal  0.883616 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  25.96 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 		 329 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.2 
 
 		 616 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  25.41 
 
 		 785 aa  93.2  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.5 
 
 		 323 aa  92.8  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  30.19 
 
 		 353 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  26.95 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.27 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  29.27 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.28 
 
 		 351 aa  89.7  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0098  glycosyltransferase-like protein  26.99 
 
 		 276 aa  90.1  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000850354 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.65 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 348 aa  87  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.51 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  27.91 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 374 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  44.79 
 
 		 1168 aa  85.9  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 324 aa  85.9  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  44.33 
 
 		 1157 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  25.09 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  27.27 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  26.32 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  27.85 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  31.02 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 		 358 aa  82.4  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  33.1 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2886  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 573 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 573 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3457  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  41.3 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0842  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.752789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  39.36 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3721  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  27.14 
 
 		 672 aa  80.1  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  28.51 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  42.27 
 
 		 1148 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 		 672 aa  79.7  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.47 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  27.23 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  37.5 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.47 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  40.21 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 341 aa  79  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  45.16 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1430  beta-1,4-galactosyltransferase, putative  37.82 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0431  putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC  35.34 
 
 		 1636 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  39.36 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  27.42 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 		 689 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  38.74 
 
 		 970 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 		 1116 aa  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  37.37 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  41.24 
 
 		 1173 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1197  glycosyl transferase family 2  21.29 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0797043  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  27.27 
 
 		 1169 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  40.82 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>