More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4093 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  98.84 
 
 
344 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  98.84 
 
 
344 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  100 
 
 
344 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  98.84 
 
 
344 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  97.97 
 
 
344 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  80.17 
 
 
344 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  80.17 
 
 
344 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  80.17 
 
 
344 aa  593  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  80.17 
 
 
344 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  80.17 
 
 
344 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  79.88 
 
 
344 aa  589  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  79.59 
 
 
344 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  79.3 
 
 
344 aa  587  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  49.06 
 
 
332 aa  315  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  38.49 
 
 
327 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  35.81 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.84 
 
 
326 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 
358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.95 
 
 
326 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.25 
 
 
329 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.95 
 
 
326 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.25 
 
 
329 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
341 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  31.78 
 
 
353 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.67 
 
 
326 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.88 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.57 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  31.53 
 
 
321 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  25.2 
 
 
325 aa  110  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  30.49 
 
 
785 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
390 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
333 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.43 
 
 
970 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
384 aa  106  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1296  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
343 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2900  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
349 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
351 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.39 
 
 
616 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  39.64 
 
 
398 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  32.05 
 
 
346 aa  103  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
324 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  30.13 
 
 
343 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.91 
 
 
1168 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  26.67 
 
 
333 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1126  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
390 aa  100  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.463481  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  37.39 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
341 aa  99.4  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 
324 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  28.78 
 
 
1157 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  38.02 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0585  glycosyl transferase  28.45 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  40.71 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.44 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  41.44 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  40.17 
 
 
303 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
325 aa  96.3  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  41.9 
 
 
397 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
335 aa  95.9  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.61 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  43.27 
 
 
380 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  26.47 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0718  putative sugar transferase  26.59 
 
 
451 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  44.55 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1428  glycosyltransferase-like protein  29.49 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221347  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  43.69 
 
 
330 aa  93.2  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31.31 
 
 
731 aa  93.2  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  30.66 
 
 
1169 aa  92.8  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  27.15 
 
 
341 aa  92  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.2 
 
 
295 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  30.45 
 
 
946 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  33.87 
 
 
1173 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  46.24 
 
 
672 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  47.78 
 
 
230 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  26.67 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2037  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.537056 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  27.14 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  38.74 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  39.64 
 
 
307 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.79 
 
 
380 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  45 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  37.72 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  27.98 
 
 
697 aa  91.3  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  42.11 
 
 
1148 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  32.55 
 
 
729 aa  89.7  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  40 
 
 
327 aa  89.4  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  27.38 
 
 
349 aa  88.6  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  43.33 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  37.82 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  44.55 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.94 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
553 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.83 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>