More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1126 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1126  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
390 aa  815    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.463481  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2037  glycosyl transferase family 2  41.14 
 
 
369 aa  300  3e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.537056 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.05 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  41.94 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 
1116 aa  110  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  40 
 
 
325 aa  110  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  38.3 
 
 
349 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  43.4 
 
 
333 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
341 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  27.85 
 
 
1157 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1145  glycosyltransferase-like protein  40.62 
 
 
342 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122367  hitchhiker  0.000000285073 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.78 
 
 
329 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0716  putative sugar transferase  27.98 
 
 
448 aa  103  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.78 
 
 
329 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2094  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
334 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  41.35 
 
 
353 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  29.29 
 
 
344 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  41.74 
 
 
328 aa  99.8  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
341 aa  99.4  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  29.29 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.59 
 
 
616 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  29.29 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  39.45 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  28.87 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  26.99 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  42.02 
 
 
697 aa  97.1  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  28.87 
 
 
344 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  27.33 
 
 
346 aa  95.5  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  27.47 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  27.47 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  34.43 
 
 
325 aa  93.6  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
327 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.54 
 
 
327 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  27.47 
 
 
344 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  27.47 
 
 
344 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  35.09 
 
 
327 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 
344 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  27.47 
 
 
344 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.09 
 
 
327 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
355 aa  92.8  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  27.47 
 
 
344 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  27.47 
 
 
344 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.09 
 
 
327 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  35.09 
 
 
327 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  38.18 
 
 
321 aa  92  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.21 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  28.94 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
348 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  26.8 
 
 
1173 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  37.93 
 
 
341 aa  90.5  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  40.2 
 
 
343 aa  90.1  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.45 
 
 
731 aa  89.7  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  42.42 
 
 
684 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  28.63 
 
 
785 aa  89.7  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
324 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
777 aa  89.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.27 
 
 
326 aa  89.4  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
983 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1296  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  30.96 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1193  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
871 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  38.3 
 
 
333 aa  87.8  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  38.53 
 
 
1168 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
340 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0719  putative sugar transferase  38.83 
 
 
331 aa  87.4  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.32 
 
 
351 aa  87  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
369 aa  87  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.53 
 
 
295 aa  87  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  41 
 
 
341 aa  86.7  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.87 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  43.14 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  32.57 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  25.97 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  23.62 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  35.78 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
553 aa  83.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  24.89 
 
 
1169 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.72 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.45 
 
 
729 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 
1032 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  32.43 
 
 
1148 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  23.99 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
155 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>