215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2091 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  100 
 
 
231 aa  437  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  49.33 
 
 
247 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  43.35 
 
 
235 aa  161  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  43.3 
 
 
225 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  39.3 
 
 
226 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  37.23 
 
 
228 aa  129  6e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.74 
 
 
236 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  40.26 
 
 
234 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
226 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  32.44 
 
 
228 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  40.87 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.04 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.97 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
226 aa  115  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  32.91 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  30.09 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 
227 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
227 aa  111  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
441 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  37.5 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
228 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
233 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
222 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 
222 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
458 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 
227 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  35.81 
 
 
422 aa  105  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  37.72 
 
 
224 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.48 
 
 
231 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  33 
 
 
230 aa  102  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.84 
 
 
229 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 
238 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  33.47 
 
 
242 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2276  glycosyl transferase family 2  37.83 
 
 
236 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  34.89 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  30.97 
 
 
228 aa  99  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  38.38 
 
 
229 aa  99  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  32.65 
 
 
246 aa  95.1  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.44 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 
345 aa  93.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  41.38 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
435 aa  88.6  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
232 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  32 
 
 
360 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4363  glycosyl transferase family protein  35.03 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273335  normal  0.0171455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 
374 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  26.32 
 
 
259 aa  72  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3258  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.777237 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12329  predicted protein  32.84 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0589  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.32 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0282701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1224  hypothetical protein  32.03 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2337  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.61 
 
 
361 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0711  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1079  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  28.11 
 
 
288 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  22.64 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 
240 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1205  hypothetical protein  31.25 
 
 
187 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
357 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  35.93 
 
 
240 aa  62.4  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0071  glycosyl transferase family 2  23.44 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  38.83 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
244 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 
232 aa  55.1  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
785 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
341 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2163  hypothetical protein  31.87 
 
 
160 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
233 aa  52  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
225 aa  52  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
640 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.32 
 
 
2401 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  30.85 
 
 
354 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.11 
 
 
427 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
535 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1803  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
256 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.5 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
251 aa  48.9  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.35 
 
 
334 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  24.11 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>