60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0589 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0589  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
375 aa  734    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0282701 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  47.47 
 
 
251 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.45 
 
 
264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2276  glycosyl transferase family 2  39.74 
 
 
236 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 
233 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  33.23 
 
 
226 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  41.43 
 
 
441 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
226 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  34.1 
 
 
226 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
228 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
227 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  36.1 
 
 
227 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
232 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  30.6 
 
 
246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
234 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  33.2 
 
 
422 aa  116  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  38.72 
 
 
224 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  38.65 
 
 
229 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  39.3 
 
 
234 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 
222 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  40.29 
 
 
458 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 
222 aa  106  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  36.94 
 
 
242 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
235 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
238 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  27.1 
 
 
228 aa  99.8  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  36.67 
 
 
225 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
244 aa  94  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
232 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
435 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
230 aa  90.5  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  23.62 
 
 
236 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
227 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12329  predicted protein  34.47 
 
 
207 aa  86.3  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  19.81 
 
 
226 aa  84  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  21.5 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  27.98 
 
 
228 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  23.47 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  35.78 
 
 
231 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  23.83 
 
 
229 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  20.87 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  25.39 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
227 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.04 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  28.44 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  20.9 
 
 
259 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
244 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  24.28 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  23.96 
 
 
229 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 
242 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  25.07 
 
 
288 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  39.32 
 
 
247 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
376 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
231 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
245 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0711  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
345 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>