More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1771 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 230 aa  470  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  66.67 
 
 		 435 aa  317  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  63.48 
 
 		 232 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  59.39 
 
 		 230 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  58.67 
 
 		 227 aa  261  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  54.02 
 
 		 227 aa  252  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  40.43 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  37.87 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  33.19 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 441 aa  107  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  32.13 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 374 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  36.12 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  32.44 
 
 		 422 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  30.21 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  30.86 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.29 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.95 
 
 		 361 aa  95.9  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 458 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 376 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  29.75 
 
 		 288 aa  88.2  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.22 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  29.39 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.76 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  30.53 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  31.62 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.74 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2276  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0589  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.51 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0282701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.92 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.61 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  28.63 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  30.09 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  25.74 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.74 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.33 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  25.32 
 
 		 253 aa  72  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  28.64 
 
 		 360 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  28.78 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  27.85 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.32 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0711  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.84 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 		 284 aa  65.1  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  29.51 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 525 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.68 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1040  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.852746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.36 
 
 		 2401 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 581 aa  59.3  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 		 399 aa  58.9  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 344 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  37.93 
 
 		 694 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  36.08 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  36.08 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  36.08 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  36.08 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  36.08 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  36.08 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  36.08 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>