More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1623 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 224 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  63.23 
 
 		 227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  58.82 
 
 		 244 aa  263  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  58.56 
 
 		 234 aa  251  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  55.2 
 
 		 222 aa  245  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  53.33 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  47.08 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  52.7 
 
 		 229 aa  214  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  52.04 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  39.64 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  39.46 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  39.73 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  40.65 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  41.89 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  41.18 
 
 		 422 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  40.54 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  38.74 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2276  glycosyl transferase family 2  41.1 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  37.67 
 
 		 441 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  37.79 
 
 		 458 aa  128  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  34.22 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  33.19 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  33.04 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  34.02 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  29.6 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.35 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.01 
 
 		 264 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  30.09 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0589  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.45 
 
 		 375 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0282701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  30.14 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 244 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.04 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.84 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  31.25 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  37.72 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  34.51 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  38.63 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  36.1 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.63 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.7 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 435 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  33.64 
 
 		 288 aa  91.3  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 376 aa  88.2  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  28.97 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12329  predicted protein  32.97 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1040  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.852746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.51 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0640  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  29.06 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  22.46 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  25.82 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.29 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.82 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 		 327 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.29 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 1101 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.75 
 
 		 123 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 335 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  24.77 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.2 
 
 		 1099 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 349 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.77 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>