More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2740 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
374 aa  742    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  63.32 
 
 
361 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  53.47 
 
 
376 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  45.09 
 
 
360 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  49.86 
 
 
348 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0711  glycosyl transferase family 2  50.14 
 
 
348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 
345 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
435 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
232 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
230 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  31.22 
 
 
246 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  34.8 
 
 
229 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
441 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
231 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  33.02 
 
 
259 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
232 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  36.4 
 
 
222 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.9 
 
 
236 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
227 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
234 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
227 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 
227 aa  99.8  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
227 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.3 
 
 
234 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
226 aa  98.6  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
238 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  31.98 
 
 
234 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
244 aa  97.1  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
226 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  39.27 
 
 
229 aa  96.3  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  30.37 
 
 
230 aa  96.3  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  33.33 
 
 
422 aa  96.3  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
228 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
458 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
225 aa  92.8  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 
234 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
224 aa  90.5  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
222 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
235 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
251 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  32.08 
 
 
228 aa  87.4  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
226 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
244 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  34.82 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  27.1 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.97 
 
 
231 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  32.48 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  28.51 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
242 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.03 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
226 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  28.52 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
239 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.64 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  28.02 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.31 
 
 
229 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  33.66 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  25.12 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
265 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  21.46 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0656  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.42 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.737559 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
268 aa  64.7  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  23.32 
 
 
322 aa  63.9  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
316 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
233 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  27.73 
 
 
822 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
256 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
232 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 
370 aa  62.8  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  38.89 
 
 
285 aa  62.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  42.22 
 
 
266 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1040  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
242 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.852746  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  29.67 
 
 
247 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
270 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 
271 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
485 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
485 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
485 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.62 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.62 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  34.21 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 
284 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
236 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
259 aa  61.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
272 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.62 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  38.89 
 
 
276 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  22.65 
 
 
273 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
299 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>