More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1927 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  100 
 
 
360 aa  743    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  43.84 
 
 
376 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  45.09 
 
 
374 aa  292  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.79 
 
 
361 aa  242  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  38.62 
 
 
348 aa  215  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0711  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  35.88 
 
 
345 aa  183  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
232 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
222 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
227 aa  90.5  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
435 aa  89.4  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  28.57 
 
 
422 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
227 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
234 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
227 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
238 aa  85.9  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  28.24 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  28.51 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  32 
 
 
231 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
232 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  26.91 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
231 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  29.96 
 
 
242 aa  77  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  27 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  27.35 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.8 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  29.55 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.04 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
230 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
244 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  27.23 
 
 
228 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  29.95 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.78 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
229 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  30.22 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
247 aa  67  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
242 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
247 aa  63.9  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
227 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
272 aa  63.5  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
233 aa  62.8  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
244 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  23.26 
 
 
227 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  27.03 
 
 
229 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.19 
 
 
329 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
341 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
322 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
308 aa  59.3  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
441 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  32.63 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
245 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
264 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
226 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
248 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
305 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.52 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
265 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  21.88 
 
 
227 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.34 
 
 
242 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 
334 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  30.16 
 
 
1169 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
305 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
262 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.85 
 
 
637 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 
324 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.59 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  37.23 
 
 
337 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
777 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  23.48 
 
 
326 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
622 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.41 
 
 
229 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
297 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
297 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.17 
 
 
327 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
318 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
1037 aa  52.8  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
348 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
299 aa  52.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
276 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  31.31 
 
 
295 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1431  glycosyltransferase-like protein  25.74 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>