More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3382 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
225 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  53.68 
 
 
235 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  40 
 
 
228 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  43.3 
 
 
231 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  36.89 
 
 
236 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.63 
 
 
234 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  33.19 
 
 
234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 
226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  35.1 
 
 
227 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  39.38 
 
 
229 aa  143  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  41.23 
 
 
422 aa  142  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
247 aa  141  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.63 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  34.22 
 
 
228 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 
222 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
228 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  38.22 
 
 
441 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  37.86 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  40.62 
 
 
458 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.7 
 
 
229 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 
251 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  36.56 
 
 
234 aa  121  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 
226 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
224 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  31.58 
 
 
228 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.56 
 
 
264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  34.06 
 
 
233 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2276  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  33.78 
 
 
229 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3258  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 
211 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.777237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 
234 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
244 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
435 aa  102  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
227 aa  101  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
238 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  33.61 
 
 
242 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  30.53 
 
 
246 aa  99  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
222 aa  98.2  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 
345 aa  96.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  30.34 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0589  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.71 
 
 
375 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0282701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.68 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2337  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12329  predicted protein  31.67 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1079  hypothetical protein  34.08 
 
 
187 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4363  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273335  normal  0.0171455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1205  hypothetical protein  34.08 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  27 
 
 
360 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  26.47 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1224  hypothetical protein  33.55 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  34.46 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2163  hypothetical protein  39 
 
 
160 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
348 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  26.34 
 
 
288 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0711  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
348 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
231 aa  62  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 
235 aa  61.6  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
247 aa  58.9  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  34.62 
 
 
321 aa  58.9  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
299 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  32.52 
 
 
332 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
349 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
284 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  46.07 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
327 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 
256 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 
357 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  37.78 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
327 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
414 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
285 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
242 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
244 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  29.7 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  34.36 
 
 
275 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
299 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0939  hypothetical protein  33.63 
 
 
173 aa  52  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 
346 aa  52  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
260 aa  52  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
221 aa  52  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  35.09 
 
 
274 aa  52  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>