More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3929 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
256 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  61.75 
 
 
254 aa  318  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  49.14 
 
 
272 aa  221  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  46.28 
 
 
250 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  50 
 
 
274 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  44.8 
 
 
253 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  41.63 
 
 
255 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  45.2 
 
 
253 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  40.25 
 
 
257 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 
250 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 
250 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 
250 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 
250 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  41.83 
 
 
255 aa  184  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  41.39 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  39.44 
 
 
265 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  41.08 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.66 
 
 
234 aa  180  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  41.7 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  41.53 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  42.28 
 
 
263 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  41.06 
 
 
249 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  38.24 
 
 
231 aa  176  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  40.74 
 
 
254 aa  175  6e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.49 
 
 
254 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  41.49 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.49 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  41.49 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  41.06 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  41.49 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  41.49 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  41.49 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  41.87 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.87 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  41.87 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  38.65 
 
 
257 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
258 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 
250 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 
250 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
249 aa  168  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
257 aa  168  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  40.08 
 
 
258 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  33.19 
 
 
231 aa  167  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.11 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  39.11 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  39.18 
 
 
259 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  39.76 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  37.6 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  38.78 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  38.74 
 
 
257 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  38.74 
 
 
257 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  38.78 
 
 
259 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  35.32 
 
 
256 aa  161  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  38.62 
 
 
263 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  38.84 
 
 
263 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 
310 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 
310 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 
309 aa  158  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3875  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0296583  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  32.76 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  37.25 
 
 
256 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  38.4 
 
 
255 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  36.07 
 
 
252 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
261 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 
280 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  34.84 
 
 
254 aa  149  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 
247 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  33.33 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  33.33 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.92 
 
 
260 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 
260 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
255 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
252 aa  142  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
301 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2126  glycosyl transferase family 2  39.92 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.81 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 
521 aa  138  7e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1250  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 
270 aa  138  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188831  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 
535 aa  138  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
251 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
249 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0011  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
251 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.360416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 
260 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  38.31 
 
 
260 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  35.34 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  36.08 
 
 
257 aa  135  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.1 
 
 
269 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  36.69 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  37.9 
 
 
260 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  33.99 
 
 
255 aa  133  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4045  glycosyl transferase family protein  35.97 
 
 
285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  31.71 
 
 
253 aa  132  6e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  36.84 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>