More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0609 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 253 aa  528  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  86.96 
 
 		 253 aa  477  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  56.45 
 
 		 260 aa  294  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  53.75 
 
 		 255 aa  281  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  55.1 
 
 		 263 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  51.41 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  51.19 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  50.6 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  51.02 
 
 		 250 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  51.43 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  51.43 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  51.43 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  49.8 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  49.4 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.79 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.41 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  48.41 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  48.41 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  48.41 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  48.41 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  48.41 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  51.44 
 
 		 254 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  49.8 
 
 		 250 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  49.39 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  46.22 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  46.96 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  42.8 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  40.64 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  41.13 
 
 		 263 aa  198  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  42.04 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.39 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  39.27 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  39.84 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  41.87 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  40.24 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  40.24 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.24 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  43.39 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  41.67 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  40.24 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  41.46 
 
 		 260 aa  181  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  41.46 
 
 		 260 aa  181  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.94 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  37.5 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  41.57 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  38.4 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  37.45 
 
 		 515 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  37.6 
 
 		 250 aa  174  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  37.1 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  40.15 
 
 		 255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  38.8 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  36.68 
 
 		 515 aa  171  9e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1799  hypothetical protein  37.7 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561578 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  35.91 
 
 		 516 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  36.95 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  39.33 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  36.63 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  37.19 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 		 254 aa  162  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  36.8 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  33.75 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  39.26 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  39.26 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  32.95 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  39.37 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 		 521 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  38.55 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1803  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.94 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  31.67 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 		 535 aa  149  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.92 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0586  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4816  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  37.05 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 		 272 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.44 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2885  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0109096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 		 310 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>