More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3579 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  80.44 
 
 
274 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  49.14 
 
 
256 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  44.13 
 
 
255 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  35.54 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 
249 aa  168  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  40.96 
 
 
259 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  39.44 
 
 
255 aa  162  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  40.08 
 
 
263 aa  161  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
257 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.51 
 
 
252 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 
258 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  37.12 
 
 
265 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 
261 aa  158  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 
258 aa  158  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  39.56 
 
 
249 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
255 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 
254 aa  155  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  38.17 
 
 
231 aa  155  9e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  38.55 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  38 
 
 
253 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  31.54 
 
 
231 aa  150  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
249 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.18 
 
 
254 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 
256 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.78 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  38.78 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  38.78 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  38.78 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  38.78 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  38.78 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  36.08 
 
 
259 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  38.06 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  38.17 
 
 
256 aa  145  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  36.99 
 
 
250 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  36.65 
 
 
260 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.65 
 
 
260 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  36.65 
 
 
260 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 
263 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  39.18 
 
 
254 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 
255 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 
263 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 
250 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  36 
 
 
257 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  36 
 
 
257 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 
250 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.61 
 
 
234 aa  138  7e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
257 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.88 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  35.32 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
261 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.19 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  35.57 
 
 
267 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  32.39 
 
 
256 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4816  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 
280 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  37.15 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  31.75 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  31.75 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  30.68 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1250  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
270 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188831  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 
301 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
260 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34 
 
 
255 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  29.82 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  30.3 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.3 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0011  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.360416  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
249 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  35.58 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
249 aa  119  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 
288 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
310 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
310 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
309 aa  118  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  32.31 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
251 aa  116  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  31.88 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  31.47 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0427  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.91 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
521 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3875  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0296583  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
252 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3379  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.68 
 
 
295 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0370  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.52 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>