More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2344 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  100 
 
 		 249 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  61.04 
 
 		 250 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  46.47 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  42.17 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  43.57 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  39.2 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  41.49 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  41.87 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  40.65 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.93 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.42 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  36.97 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  41.91 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  41.25 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  40.25 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  41.15 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  38.02 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  41.6 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  39.51 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  39.52 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  38.37 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  36.97 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  39.57 
 
 		 241 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  38.68 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  38.68 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.6 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  37.6 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.32 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1799  hypothetical protein  40.33 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  35.12 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  36.82 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  35.34 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.14 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  36.14 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  35.74 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  35.74 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  35.74 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  35.74 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  34.94 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.74 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  33.6 
 
 		 515 aa  162  6e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  38.91 
 
 		 272 aa  161  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 		 250 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 		 250 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 		 250 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  35.15 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.76 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  32.94 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  33.99 
 
 		 516 aa  155  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  39.33 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  34.39 
 
 		 515 aa  155  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1803  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 		 521 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.52 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  32.52 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  34.84 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0586  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  34.84 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 		 535 aa  145  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 		 249 aa  145  8.000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  34.43 
 
 		 259 aa  144  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  36.95 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0011  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.360416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2885  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0109096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.33 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 		 249 aa  135  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3379  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.06 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3334  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0427  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.2 
 
 		 293 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>