More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0234 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  100 
 
 		 265 aa  542  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  99.61 
 
 		 257 aa  523  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  39.26 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  34.69 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 		 257 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  33.33 
 
 		 515 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  38.27 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  35.63 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.86 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  37.86 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  36.08 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  33.2 
 
 		 516 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 255 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 		 249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.5 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  30.42 
 
 		 231 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  32.56 
 
 		 515 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  32.82 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  32.82 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  33.75 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.93 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 257 aa  121  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0011  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.360416  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  32 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  32 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2126  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.62 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  29.92 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  31.72 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  31.85 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  35.12 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  32.44 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29.64 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0586  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  35.32 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1799  hypothetical protein  32.8 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 241 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.65 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.65 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.28 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.65 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.65 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.65 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.65 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.65 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  31.27 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  33.06 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 535 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0120  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 521 aa  106  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.65 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4816  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  32.5 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>