279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0850 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 265 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  41.87 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  39.44 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.9 
 
 		 252 aa  179  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  40.49 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  37.05 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 254 aa  168  8e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  37.12 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  36 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  33.99 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  35.18 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.66 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.66 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  32.52 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.66 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.66 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.66 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.66 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.66 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 		 250 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.55 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  35.08 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3875  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  32.17 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  33.07 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  33.86 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  32.81 
 
 		 515 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.67 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  32.02 
 
 		 516 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  32.67 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  31.98 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.59 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  30.59 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  31.25 
 
 		 231 aa  130  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  31.67 
 
 		 231 aa  129  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0862  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0427  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.09 
 
 		 293 aa  125  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.28 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 521 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0981  beta 1,4 glucosyltransferase  30.27 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  29.53 
 
 		 515 aa  122  8e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0370  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.72 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  29.18 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  31.75 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3379  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.23 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  33.99 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  33.97 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29.8 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1803  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.46 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 535 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  31.95 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  31.85 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  31.54 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>