More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3225 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
261 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  41.7 
 
 
257 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  42.17 
 
 
249 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  41.49 
 
 
249 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  41.87 
 
 
260 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  38.15 
 
 
250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  38.21 
 
 
252 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
256 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
254 aa  174  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
257 aa  172  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.04 
 
 
260 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  38.62 
 
 
257 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  37.15 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  39.58 
 
 
259 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  38.75 
 
 
259 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 
257 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  35.63 
 
 
272 aa  158  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  36.22 
 
 
254 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  35.89 
 
 
257 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
259 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  35.89 
 
 
257 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  37.4 
 
 
256 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  36.65 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
255 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  33.47 
 
 
259 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  34.57 
 
 
249 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
253 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  32.64 
 
 
231 aa  153  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  33.47 
 
 
260 aa  152  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  33.47 
 
 
260 aa  152  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
258 aa  151  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
256 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.2 
 
 
260 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  33.2 
 
 
260 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 
255 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
260 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  34.68 
 
 
254 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
254 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 
253 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
258 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  34.73 
 
 
231 aa  149  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
255 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.54 
 
 
234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  34.13 
 
 
263 aa  145  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 
250 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 
250 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 
250 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0563  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
282 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  32.38 
 
 
256 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
250 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 
255 aa  143  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.54 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  32.41 
 
 
253 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.14 
 
 
254 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.07 
 
 
255 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.14 
 
 
254 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 
249 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  31.75 
 
 
254 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  31.75 
 
 
254 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  31.75 
 
 
254 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  31.75 
 
 
254 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.06 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.13 
 
 
269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  32.42 
 
 
515 aa  135  9e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1404  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
280 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189362  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  31.35 
 
 
267 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1799  hypothetical protein  33.6 
 
 
249 aa  132  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  31.75 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  30.86 
 
 
516 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.24 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  28.91 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  30.61 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
249 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3875  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
313 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0296583  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
309 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2885  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
287 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0109096 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
267 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0011  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
251 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.360416  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
255 aa  119  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
288 aa  118  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  28.07 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3379  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.85 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0427  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.55 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  32.03 
 
 
265 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>