More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3892 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
255 aa  526  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  52.78 
 
 
255 aa  265  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  44.4 
 
 
269 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  45.15 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  44.73 
 
 
259 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  41.8 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  41.57 
 
 
253 aa  178  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  41.43 
 
 
255 aa  175  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  38.65 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  40.32 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  40.32 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
260 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  39.29 
 
 
267 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  40.47 
 
 
257 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.15 
 
 
255 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  37.85 
 
 
256 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  38.58 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
257 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
257 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  38.08 
 
 
253 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  37.6 
 
 
256 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  37.01 
 
 
250 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  37.01 
 
 
250 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  37.01 
 
 
250 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.4 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  36.26 
 
 
254 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.26 
 
 
254 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  35.88 
 
 
254 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  35.88 
 
 
254 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  35.88 
 
 
254 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  35.88 
 
 
254 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 
254 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
249 aa  154  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  35.69 
 
 
259 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  38.19 
 
 
254 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
250 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
257 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 
258 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
250 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  38.28 
 
 
263 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  36.69 
 
 
256 aa  149  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 
263 aa  148  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
258 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  36.65 
 
 
521 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
250 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 
260 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.55 
 
 
260 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  37.55 
 
 
260 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 
261 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
254 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  36 
 
 
257 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
535 aa  142  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 
257 aa  138  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  37.3 
 
 
265 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
256 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.61 
 
 
234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  32.64 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.73 
 
 
252 aa  132  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  33.99 
 
 
249 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  32.64 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  35.88 
 
 
515 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  34.12 
 
 
274 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  34.33 
 
 
516 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.37 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  33.74 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
255 aa  125  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  30.28 
 
 
254 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 
257 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  33.2 
 
 
253 aa  122  8e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1803  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2126  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
277 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
259 aa  118  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
252 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1250  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 
270 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188831  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
263 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  27.27 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4045  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
285 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
241 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0586  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
249 aa  106  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
279 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
260 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  30.92 
 
 
515 aa  103  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
261 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.43 
 
 
256 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>