More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2347 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  98.8 
 
 
250 aa  497  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  94 
 
 
250 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  94 
 
 
250 aa  477  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  94 
 
 
250 aa  477  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  92.4 
 
 
250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  82.38 
 
 
253 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  84.08 
 
 
254 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  84.08 
 
 
254 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  84.08 
 
 
254 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  84.08 
 
 
254 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  84.08 
 
 
254 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  83.67 
 
 
254 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  84.08 
 
 
254 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  84.08 
 
 
254 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  84.02 
 
 
253 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  75.41 
 
 
255 aa  394  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  54.36 
 
 
255 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  52.08 
 
 
256 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  52.44 
 
 
263 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  51.05 
 
 
260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  51.02 
 
 
253 aa  249  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  50.61 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  52.72 
 
 
256 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  47.93 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  47.93 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  46.89 
 
 
249 aa  211  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  40.49 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  40.49 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  40.32 
 
 
259 aa  195  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.27 
 
 
255 aa  195  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  42.45 
 
 
257 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  38.78 
 
 
256 aa  193  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  39.92 
 
 
257 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  43.09 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.08 
 
 
260 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  40.25 
 
 
258 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  43.39 
 
 
249 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
258 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  41.06 
 
 
263 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  40.42 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  43.15 
 
 
255 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  40 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  40.33 
 
 
260 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  40.33 
 
 
260 aa  182  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.33 
 
 
260 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  37.5 
 
 
267 aa  178  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 
256 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  39.36 
 
 
255 aa  175  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  38.43 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
257 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  34.4 
 
 
515 aa  169  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  37.08 
 
 
250 aa  168  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
241 aa  168  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.61 
 
 
234 aa  167  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  39.36 
 
 
263 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  33.6 
 
 
516 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  40.42 
 
 
254 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  33.2 
 
 
515 aa  163  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  35.39 
 
 
254 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.39 
 
 
254 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.13 
 
 
256 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1799  hypothetical protein  39.84 
 
 
249 aa  161  9e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  35.98 
 
 
249 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 
270 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  30.74 
 
 
257 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  30.25 
 
 
231 aa  158  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  37.01 
 
 
255 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
247 aa  154  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  32.77 
 
 
231 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  33.73 
 
 
254 aa  152  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  40.57 
 
 
274 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0586  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
249 aa  149  6e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.23 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.3 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1803  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
261 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
254 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
280 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 
272 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.66 
 
 
255 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 
249 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
521 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
535 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
249 aa  128  8.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 
279 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 
267 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2725  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
278 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
249 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 
260 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  36.69 
 
 
260 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
257 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  33.88 
 
 
265 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
310 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>