More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0347 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  95.77 
 
 		 260 aa  507  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4045  glycosyl transferase family protein  77.69 
 
 		 285 aa  407  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4586  glycosyl transferase family 2  37.75 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0951423  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3028  glycosyl transferase family protein  38.25 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633181  normal  0.0348556 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  36.78 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  36.78 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2126  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  34.77 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  32.8 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  35.41 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  30.59 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  35.89 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  34.77 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  33.2 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.86 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 521 aa  122  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  33.61 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 249 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 535 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1250  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188831  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  32.24 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.78 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  33.91 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  33.48 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  32.69 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  33.19 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  33.19 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  37.5 
 
 		 253 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  38.24 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.06 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  31.73 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.77 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.5 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  30.36 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.36 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  32.81 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1803  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.94 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.94 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.94 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.94 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.94 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.94 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.27 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  33.77 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.77 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 288 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2725  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 253 aa  102  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0120  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0586  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  28.63 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0862  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0981  beta 1,4 glucosyltransferase  29.37 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>