More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1250 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1250  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188831  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  33.07 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2126  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  34.65 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  36.82 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  34.32 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4045  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  28.98 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  30.83 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  30.83 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.27 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0011  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.360416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  30.47 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29.12 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  29.82 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  25 
 
 		 231 aa  95.9  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.4 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  26.27 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 301 aa  90.1  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.6 
 
 		 252 aa  89.4  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 260 aa  89.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3181  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 261 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 535 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3875  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0862  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  28.19 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.49 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  25.49 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0981  beta 1,4 glucosyltransferase  28.41 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2885  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0109096 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  26.38 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  27.1 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  26.69 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  27.27 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  26.69 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4816  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1301  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  25.3 
 
 		 515 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0120  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2725  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0563  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  23.94 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  27.59 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  25 
 
 		 516 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3334  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>