More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4586 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4586  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
272 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0951423  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3028  glycosyl transferase family protein  82.42 
 
 
285 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633181  normal  0.0348556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4045  glycosyl transferase family protein  41.44 
 
 
285 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  37.75 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  37.75 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  36.55 
 
 
260 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
252 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
257 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
270 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  31.87 
 
 
269 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  33.59 
 
 
256 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
254 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  26.79 
 
 
254 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
254 aa  99  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 
251 aa  98.6  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  28.52 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  29.23 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  29.23 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  29.46 
 
 
254 aa  95.9  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.46 
 
 
254 aa  95.9  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  29.27 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 
255 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0011  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.360416  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
255 aa  92.4  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
261 aa  92  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2126  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  26.51 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0862  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
521 aa  89  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
250 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
257 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  27.17 
 
 
265 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  28.4 
 
 
259 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
260 aa  86.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0981  beta 1,4 glucosyltransferase  30.99 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
255 aa  85.5  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
249 aa  85.5  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  24.5 
 
 
256 aa  85.5  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 
257 aa  85.5  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
241 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  28.86 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  30.15 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
535 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.01 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.23 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  28.14 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  28.14 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  28.14 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  28.14 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.85 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.14 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  28.14 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0252  glycosyl transferase family 2  45.36 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2590  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  25.44 
 
 
515 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  25.67 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.37 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.69 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  28.69 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.6 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.57 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  42.55 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1301  glycosyl transferase family protein  41.35 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  24.03 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  44.09 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  25.7 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>