More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4606 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  78.28 
 
 		 267 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  56.15 
 
 		 272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4816  glycosyl transferase family protein  54.96 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  40 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  37.6 
 
 		 253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 257 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 		 256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  35.68 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.2 
 
 		 234 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  37.15 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  34.44 
 
 		 231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 		 253 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  36.43 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 258 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  38.37 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  37.2 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  30.16 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  28.22 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2885  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0109096 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  37.2 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.2 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  37.2 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  37.2 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  34.4 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.4 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  37.2 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  37.2 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.43 
 
 		 254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  31.43 
 
 		 254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.67 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  28.74 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  35.18 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.8 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  31.3 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.6 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  31.33 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  31.33 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.26 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  28.24 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  30.65 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  30.89 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 521 aa  99  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  34.87 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  31.98 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 535 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  26.8 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  31.58 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  27.74 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0252  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 308 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  29.34 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>