More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3028 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3028  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
285 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633181  normal  0.0348556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4586  glycosyl transferase family 2  86.8 
 
 
272 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0951423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4045  glycosyl transferase family protein  40.68 
 
 
285 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  38.25 
 
 
260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  38.25 
 
 
260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  37.45 
 
 
260 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.66 
 
 
269 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 
270 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 
252 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.08 
 
 
254 aa  105  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  29.08 
 
 
254 aa  105  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
257 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
256 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  33.33 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 
247 aa  99  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
257 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
257 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
254 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  29.76 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  29.76 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  26.42 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  28.69 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.94 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
255 aa  95.9  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 
260 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  26.46 
 
 
253 aa  95.5  8e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
261 aa  95.5  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  24.9 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
250 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0011  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.360416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
259 aa  89.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.66 
 
 
254 aa  89  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
256 aa  89  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
521 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0862  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
241 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
249 aa  86.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  30.97 
 
 
253 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2126  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0981  beta 1,4 glucosyltransferase  30.25 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.48 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  26.77 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.48 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.48 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 
535 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  28.46 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.48 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.48 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.48 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.48 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2590  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  26.61 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1301  glycosyl transferase family protein  45.36 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  31.38 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  24.03 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1799  hypothetical protein  28.4 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561578 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.4 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  26.21 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.11 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  26.67 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0252  glycosyl transferase family 2  40.21 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  26.32 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.9 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  27.17 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  24.08 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  44.55 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  22.89 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1250  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188831  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>