295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0252 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0252  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
308 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2590  glycosyl transferase family 2  69.33 
 
 
310 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0566  glycosyl transferase family 2  46.5 
 
 
300 aa  271  8.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277613  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2093  glycosyl transferase family 2  45.85 
 
 
282 aa  258  7e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3908  glycosyl transferase family 2  36.56 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.078228  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  35.19 
 
 
313 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
310 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
310 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3875  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
313 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0296583  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3832  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
279 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3882  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
295 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
288 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3040  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 
292 aa  136  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.679384  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1591  family 2 glycosyl transferase  33.45 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0274  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
298 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
301 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3181  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0427  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.88 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3379  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.47 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.78 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0370  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.52 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1301  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
256 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3334  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
292 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
249 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1077  putative glycosyltransferase  28.78 
 
 
276 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
261 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
257 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  27.95 
 
 
256 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1166  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.24 
 
 
297 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
255 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
263 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
255 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6295  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 
290 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
254 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
254 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
255 aa  96.7  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
272 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
253 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
250 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29.01 
 
 
252 aa  95.5  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
255 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
261 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 
253 aa  93.6  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
263 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
257 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
255 aa  92.4  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
257 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4045  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  28.52 
 
 
253 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
267 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  26.86 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.86 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.87 
 
 
254 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  26.86 
 
 
254 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0011  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 
251 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.360416  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  27.46 
 
 
253 aa  88.2  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  26.86 
 
 
254 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  26.86 
 
 
254 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  26.86 
 
 
254 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
253 aa  87.4  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  27.37 
 
 
254 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
250 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
250 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
249 aa  85.9  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.41 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  24.82 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.18 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
247 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  29.18 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  24.49 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  25.98 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  25.19 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.41 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
260 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4586  glycosyl transferase family 2  45.36 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0951423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
249 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2126  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
249 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>