More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1364 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  99.61 
 
 
254 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  99.61 
 
 
254 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  99.61 
 
 
254 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  99.61 
 
 
254 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  99.21 
 
 
254 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  90.55 
 
 
254 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  80.4 
 
 
250 aa  420  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  83.67 
 
 
250 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  83.67 
 
 
250 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  83.67 
 
 
250 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  84.08 
 
 
250 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  83.27 
 
 
250 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  77.87 
 
 
253 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  74.59 
 
 
255 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  78.28 
 
 
253 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  54.51 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  52.4 
 
 
255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  50.61 
 
 
256 aa  261  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  52.26 
 
 
253 aa  259  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  52.42 
 
 
263 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  49.21 
 
 
253 aa  251  9.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  50.83 
 
 
256 aa  228  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  48.02 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  48.98 
 
 
257 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  44.94 
 
 
249 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  41.5 
 
 
263 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  40.56 
 
 
259 aa  195  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  40 
 
 
256 aa  194  8.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 
258 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  38.58 
 
 
255 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 
257 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  39.06 
 
 
260 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  39.06 
 
 
260 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  41.63 
 
 
257 aa  191  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 
258 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 
260 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  40.55 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.15 
 
 
260 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  41.11 
 
 
263 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  41.15 
 
 
260 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  41.15 
 
 
260 aa  182  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  42.15 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  43.15 
 
 
255 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  37.2 
 
 
267 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  40.39 
 
 
263 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  39.44 
 
 
259 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  41.49 
 
 
256 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  39.04 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  35.95 
 
 
260 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
250 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.44 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  36.14 
 
 
249 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  34.75 
 
 
515 aa  165  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  33.98 
 
 
516 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.71 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  34.57 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.57 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  32.35 
 
 
231 aa  159  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 
255 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 
241 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  34.31 
 
 
231 aa  158  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
254 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  31.27 
 
 
515 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  40.24 
 
 
274 aa  155  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
270 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  34.66 
 
 
265 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  38.78 
 
 
272 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1803  glycosyl transferase family 2  34.66 
 
 
252 aa  151  8e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1799  hypothetical protein  37.15 
 
 
249 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
257 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  31.2 
 
 
257 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
280 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.4 
 
 
269 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
247 aa  148  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.65 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  31.76 
 
 
254 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0586  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
249 aa  145  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
261 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  31.4 
 
 
252 aa  142  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
521 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
288 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  32.4 
 
 
254 aa  136  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
535 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
249 aa  128  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 
267 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
310 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
310 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  30.53 
 
 
313 aa  125  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0862  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
291 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3875  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
313 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0296583  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
309 aa  122  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>