46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4363 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4363  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273335  normal  0.0171455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1079  hypothetical protein  81.28 
 
 		 187 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1205  hypothetical protein  80.75 
 
 		 187 aa  280  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1224  hypothetical protein  70.43 
 
 		 188 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2337  glycosyl transferase family protein  70 
 
 		 190 aa  237  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  41.32 
 
 		 235 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3258  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.777237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  35.2 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  35.03 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0518  putative glycosyltransferase protein  34.21 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  0.387851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0562  putative glycosyltransferase protein  36.29 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0939  hypothetical protein  38 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0453  hypothetical protein  38 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297407  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0509  hypothetical protein  44.57 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.93 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  28.93 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.87 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  26.37 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0400  hypothetical protein  39.13 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0388  hypothetical protein  39.13 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  26.37 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 345 aa  54.7  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.31 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 		 458 aa  52  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  29.31 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  29.01 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.86 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2279  hypothetical protein  31.58 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2163  hypothetical protein  27.82 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  28.32 
 
 		 360 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  26.63 
 
 		 259 aa  45.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 435 aa  45.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2105  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.754468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 322 aa  44.7  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1742  hypothetical protein  31.37 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.112466  normal  0.298873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  24.18 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 1106 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  22.9 
 
 		 226 aa  41.6  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 441 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1810  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 		 513 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0885657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 229 aa  41.2  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>