17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1769 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1769  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  328  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2105  hypothetical protein  99.42 
 
 		 173 aa  326  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.754468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1742  hypothetical protein  89.6 
 
 		 173 aa  294  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.112466  normal  0.298873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5417  hypothetical protein  63.01 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3676  hypothetical protein  59.54 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6072  hypothetical protein  58.96 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0453  hypothetical protein  31.3 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297407  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0562  putative glycosyltransferase protein  32.82 
 
 		 185 aa  50.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0518  putative glycosyltransferase protein  34.71 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  0.387851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0939  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1224  hypothetical protein  34.94 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 235 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0509  hypothetical protein  35.51 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1079  hypothetical protein  34.26 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3258  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 		 211 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.777237 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0400  hypothetical protein  29.32 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0388  hypothetical protein  29.32 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>