More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0878 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 361 aa  714    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  63.32 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  53.54 
 
 		 376 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  53.37 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0711  glycosyl transferase family 2  52.3 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  41.79 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  39.4 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  37.4 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 232 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  39.62 
 
 		 229 aa  119  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  35.27 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 		 227 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 		 234 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 		 230 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  33.04 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  39.71 
 
 		 227 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 227 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  37.79 
 
 		 222 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.87 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.23 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 244 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  31.37 
 
 		 234 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  30.24 
 
 		 230 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  36.52 
 
 		 225 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  37.67 
 
 		 234 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 		 222 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  29.67 
 
 		 259 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 227 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  36.97 
 
 		 227 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 226 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 235 aa  96.3  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 		 226 aa  95.9  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 228 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  34.13 
 
 		 231 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  33.02 
 
 		 228 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  33.47 
 
 		 228 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 		 251 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 226 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  33.07 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.43 
 
 		 231 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.78 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  37.61 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  32.93 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  24.3 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 244 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 226 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 264 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.4 
 
 		 2401 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.84 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  30.43 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 245 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 		 619 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  23.2 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  23.2 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.29 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  23.94 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.24 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  38.18 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  22.75 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  36.46 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1428  glycosyltransferase-like protein  32.67 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.35 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  29.89 
 
 		 247 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  45.65 
 
 		 123 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 1015 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  21.31 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  26.62 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 847 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  39.5 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>