More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1247 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
259 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  77.91 
 
 
262 aa  430  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  41.77 
 
 
280 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  41.37 
 
 
280 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  41.15 
 
 
280 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 
282 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 
263 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  34.62 
 
 
268 aa  169  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  39.26 
 
 
268 aa  168  7e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 
282 aa  165  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  34.24 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  34.02 
 
 
267 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  37.55 
 
 
275 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  35.54 
 
 
515 aa  155  9e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  35.6 
 
 
516 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  38.49 
 
 
272 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 
288 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  35.34 
 
 
515 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
273 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 
278 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  35.12 
 
 
279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  35.12 
 
 
279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
988 aa  75.5  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.08 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  33.67 
 
 
344 aa  72  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.94 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  40.82 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  25.23 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06140  putative glycosyltransferase  26.75 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  34.02 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.27 
 
 
2401 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
335 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
1035 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  29.53 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  38.78 
 
 
1157 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
419 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 
358 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.96 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.93 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.93 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  38.95 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.93 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.85 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  25.64 
 
 
343 aa  65.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0910  glycosyl transferase  36.44 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 
312 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
303 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
340 aa  65.1  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 
352 aa  65.1  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
336 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 
329 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
318 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
1032 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
891 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
338 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
333 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 
299 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
369 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
326 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
328 aa  63.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
315 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  36.63 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 
373 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
373 aa  62.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
996 aa  62.4  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
313 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  32.46 
 
 
353 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
301 aa  62.4  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  36.96 
 
 
291 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0716  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
340 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000599057  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0025  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
362 aa  62  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
334 aa  62  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  35.29 
 
 
325 aa  62  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 
428 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  30.09 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  30.91 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.71 
 
 
466 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
382 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
335 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 
334 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>