More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0140 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  50.88 
 
 
236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3138  glycosyl transferase family protein  51.26 
 
 
236 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
470 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  27.82 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.18 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  29.27 
 
 
470 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
470 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1407  putative glycosyl transferase  28.64 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  33.01 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 
528 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 
581 aa  63.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
302 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
289 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
358 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.23 
 
 
1099 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  30.19 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  21.52 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
487 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
327 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
331 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
329 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
329 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
322 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
470 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
470 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
470 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
753 aa  58.5  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
244 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
455 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
345 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
232 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  28.94 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 
637 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.51 
 
 
403 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
311 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
284 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0770  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
505 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  24.65 
 
 
316 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
329 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
513 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  28.5 
 
 
303 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
477 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
312 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
304 aa  56.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  25.37 
 
 
341 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
339 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
344 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  33.52 
 
 
322 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  27.57 
 
 
296 aa  55.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 
340 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
311 aa  55.1  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  28.52 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
322 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  29.71 
 
 
411 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
325 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
346 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
352 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  29.18 
 
 
353 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0481  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 
340 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
327 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  26.76 
 
 
1644 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  26.76 
 
 
1644 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.26 
 
 
338 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
330 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
308 aa  53.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
320 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  22.46 
 
 
302 aa  52.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  29.47 
 
 
272 aa  52.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.51 
 
 
369 aa  52.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
305 aa  52  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
428 aa  52  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
225 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3950  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
778 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.75941 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 
315 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 
315 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 
315 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 
315 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>